在《全彩acg★无翼乌邪恶应用》中，主人公无名少年意外获得了一款神秘的手机应用。这个应用能够将他所喜爱的ACG角色变成活生生的实体，并赋予他们各种超能力。然而，这些角色却展现出了不同寻常的邪恶倾向。随着剧情的发展，无名少年陷入了一个充满欲望、诱惑和痛苦交织的世界之中。为了找回正常生活，他必须与自己内心深处那股黑暗势力进行斗争，并学会控制这个邪恶应用引发的后果。